Endokrin cerrahi, ağırlıklı olarak tiroit, paratiroit ve böbrek üstü (adrenal) bezleri gibi iç salgı bezlerinin (endokrin bez) ameliyat gerektiren hastalıklarına odaklanan bir genel cerrahi uzmanlık alanıdır. Ürettikleri hormonları doğrudan kan dolaşımına veren bezlere endokrin bez adı verilir.
Guatr, hipotiroidi, hipertiroidi, Graves hastalığı, tiroid nodülleri ve tiroid kanserleri gibi Tiroid bezi hastalıkları, hiperparatiroidi, hipoparatiroidi, paratiroid bezi kanseri, paratiroid adenomu ve paratiroid hiperplazi gibi paratiroid bezi hastalıkları, Cushing Sendromu, Addison Sendromu, Feokromositoma, insidentaloma, adenom ve kanser gibi böbrek üstü (sürrenal) bezi hastalıkları ve insulinoma, gastrinoma, glukagonoma, VİPoma, Zollinger-Ellison Sendromu ve karsinoid sendrom gibi pankreas hastalıkları, endokrin cerrahinin alanına giren başlıca hastalıklardır.