Gastrointestinal cerrahi, yemek borusu, mide, ince bağırsaklar, kalın bağırsaklar, anal kanal, karaciğer, safra kesesi ve safra yolları ve pankreas hastalıklarının cerrahi olarak tedavisiyle uğraşan genel cerrahi uzmanlık alanıdır. Sindirim sisteminin cerrahi olmayan hastalıklarının tanı ve tedavisi ile ise, dahiliye ve gastroenteroloji bölümleri ilgilenir.
Gastrointestinal sistem dediğimizde, ağızdan anüse kadar olan bölüm anlaşılır. Gastrointestinal sistem çiğneme, sindirim, emilim ve boşaltım olaylarının gerçekleştiği yer yani sindirim kanalıdır.
Gastrointestinal sistemi ağız, farinks (yutak), özofagus (yemek borusu), mide, ince bağırsak, kalın bağırsak (kolon ve rektum) ve makat ( anüs) oluşturur.
Sindirim sisteminde sindirim kanalına dahil olmayan ancak sindirimle ilişkili yapılar da bulunmaktadır. Bunlar; dişler, dudaklar, alt ve üst çene, tükürük bezleri, pankreas, karaciğer, safra kesesi ve safra yollarıdır.
Sindirim sisteminin başlıca görevleri besinleri çiğneme, yutma, sindirim, emilim ve boşaltım işlemidir.
Gastrointestinal sistem cerrahisi kendi arasında; üst gastrointestinal cerrahi, hepatobiliyer cerrahi (karaciğer, pankreas ve safra yolları cerrahisi) ve alt gastrointestinal sistem cerrahisi (kolorektal cerrahi) olmak üzere 3 gruba ayrılır.
Üst gastrointestinal cerrahi, yemek borusu (özofagus) ve midenin cerrahi hastalıkları ile ilgilenir. Bu hastalıklar; yemek borusunun iyi ve kötü huylu tümörleri, akalazya gibi yemek borusunun çalışma bozuklukları, gastroözofagial reflü, mide ülseri ve midenin iyi ve kötü huylu tümörleridir.
Hepatobiliyer cerrahi ise karaciğerin, safra kesesi ve safra yollarının ve pankeas bezinin ameliyat ile tedavi edilebilen hastalıkları ile ilgilenir. Uygulanan başlıca işlemler arasında karaciğer rezeksiyonları (karaciğerin bir bölümünün çıkarılması), kolesistektomi (safra kesesinin alınması), safra yollarındaki darlık ya da tümörlerin tedavisi, pankreatikoduodenektomi (pankreas ve on iki parmak bağırsağının çıkartılması) bulunmaktadır.
Alt gastrointestinal sistem cerrahisi ya da kolorektal cerrahi, kalın bağırsak ve anal kanalın hastalıklarını ameliyat ile tedavi eder. Kalın bağırsağın bir kısmının ya da tamamının kanser, polip, daralma ya da inflamatuar bağırsak hastalıkları nedeniyle alınması (kolektomi), anal kanalda görülen hemoroid (basur), fissür (makat çatlağı) ve anal fistül gibi hastalıklarının ameliyat ile tedavisi başlıca ilgi alanlarını oluşturur.